科学家正在制造人造细胞的道路上
由油中的水制成的电池:法微德国的研究团队使用微流体技术首先产生微小的液滴(顶部),然后将简单的新陈代谢成分注入其中(底部)。该条对应于100微米。© 自然通讯2018
通过将基本的代谢功能整合到一个微小的液滴中,迈出了迈向生活边界的一步。
希望在试管中产生的细胞可以回答生物学中的一些主要问题。细胞生存所需的最低限度是什么?地球上的生命是如何开始的?马格德堡马克斯·普朗克复杂技术系统动力学研究所以及CNRS的Paul Pascal研究中心和波尔多大学的研究人员现在展示了人造细胞的先驱。在合成生物学的实验中,他们成功地将代谢功能的简单形式整合到了微小的小液滴中:一种化学反应,由集成的能量供应来维持。
欧文·薛定er(ErwinSchrödinger)在他的书《生命是什么?》中问道:“生物体如何避免恶化?”,他在其中解释了生物的物理方面。根据物理学家的说法,答案很简单:“通过进食,饮水和呼吸()”。…用于此目的的专业术语是“新陈代谢”,即更好的“代谢功能”。发生的生化过程使活生物体获得能量并积累或分解物质。对于个体细胞而言,无论它们是单细胞生物还是大型生物中的有组织,新陈代谢功能对于生存和生存能力都是必不可少的。
基本的新陈代谢:在通过表面活性剂在油中稳定的水滴中,磷酸葡萄糖(G6P 1)通过脱氢酶(G6PDH)氧化为内酯(G6P 2)。反应由NAD +转化为NADH推动,随后通过倒膜囊泡(IMV)再循环。© MPI用于复杂技术系统的动力学
活细胞需要新陈代谢和对环境的限制
因此,如果合成生物学的研究人员希望合成细胞等,那么他们必须将新陈代谢整合到与环境隔离的空间中。这正是波尔多Recheche Paul Pascal中心(CRPP,英文:Paul Pascal研究中心)的Jean-Christophe Baret和马格德堡马克斯普朗克复杂技术系统动力学研究所的Kai Sundmacher领导的科学家,现在已经成功地以简化的形式进行了操作。在这里,它们的人造细胞仅由在油中形成的微小的水滴组成。他们为研究人员提供了与周围环境分离的微小单元-类似于通过膜与周围环境分离的细胞。
研究人员在这些液滴的内部添加了不同的分子成分,从而模拟了新陈代谢反应。诚然,乍一看,这种简化的合成电池看上去与天然电池非常不同。但是,可以肯定的是:“从技术的角度来看,这种最小的系统是相关的模型,可以从中开发出更接近自然的更复杂的系统,”马格德堡马克斯·普朗克研究所所长Kai Sundmacher解释说。
活细胞的决定性成分是什么?
根据马克斯·普朗克复杂技术系统动力学研究所的工程师兼研究员伊万·伊万诺夫(Ivan Ivanov)的说法,无论如何,他和他的同事最初只是想设计一个具有电池基本特性的最小系统。只有这样,才能找出哪些成分对生命最终具有决定性的意义。因此,他和他的同事一步一步地根据分子成分建立了模型代谢功能。专家在此过程中使用的行话是自下而上的原则。
对于工程师而言,自下而上的方法是日常工作的一部分,但对于合成生物学家而言,则不是。相反,它们通常使用自顶向下的原理进行工作。他们从真实的有机体开始,然后使用遗传技术对其进行修饰,从而为其赋予新的功能和特性。“在细胞的遗传物质中,有很多事情是多余的,甚至是不必要的,”伊万诺夫在谈到使用顶部的问题时解释说。下降的方法。毕竟,在这种情况下,科学家们不会了解创造生命确实需要哪些功能。
微流体技术可根据需要产生液滴
除了代谢功能外,还需要与环境隔离。正如伊万诺夫(Ivanov)解释的那样,“每个牢房在一定程度上都有一堵墙,将其与周围环境隔开。”专家称它们为隔室,既可以通过薄膜形成,也可以通过液滴形成。
研究人员正在使用所谓的“微流体技术”,这种技术使大量生产微滴并对其进行快速分析成为可能。在这里,科学家已经能够根据需要微调尺寸和成分。然后使用微流体模块,将磷酸葡萄糖和辅因子NAD +填充到隔室中。前者在一定程度上为人造细胞提供了营养,后者在辅因子NAD +存在下转化为化学终产物,同时释放化学能。
NAD +在活细胞的代谢中也起作用,并在代谢反应过程中吸收氢,从而将其转化为NADH。为了使反应得以维持,科学家添加了一个模块,该模块通过将NADH氧化回NAD +来再生NAD +。因此,辅助因子始终以其所需的形式可用。
如果磷酸葡萄糖已全部用完,则细胞会在某种程度上进入睡眠模式,这可以通过使用微量注射系统重新补充其营养来结束。
实际单元必须繁殖并存储其结构设计
根据项目负责人Jean-Christophe Baret的说法,模型代谢具有自然代谢功能的所有基本特征,并为进一步研究提供了平台:“通过微流体技术,我们可以生产受控数量的此类基本成分,并赋予它们更复杂的功能。这样,就可以检验关于由已知和受控成分创造生命的假设。”为了以一种与现实足够接近的方式真正模仿真正的细胞,此类系统还需要具有例如复制的能力,以及一种用于存储其结构设计的机制,而我们仍然面临着一系列功能。
但是,即使没有这些功能,对于出版物的主要作者托马斯·贝尼顿(Thomas Beneyton),这种人造系统也可能会以与生物学系统相似的方式运行。例如,液滴的产生可能具有“不平等的适应性”,换句话说,就是食欲不同或营养素输出量可变,并且可以在细胞之间交换营养素。以此方式,可以创建竞争状况,例如在真实小区之间也观察到的竞争状况。这样的液滴单元将完全按照规定进行工作。
出版物:Thomas Beneyton等人,“自下而上整合代谢功能的失衡微区室”,《自然通讯》,第9卷,文章编号:2391 (2018)