在大西洋中浮出水面的惊喜：海水中DNA痕迹远离家庭的物种

巴西牛鼻子射线，从未在墨西哥湾北部的北部，发现在DNA科学家的新泽西州的大西洋。

DNA科学家们采样新泽西州岸瓶，十年前预测的海洋生物的变化范围;来自海水的钓鱼DNA：一种无害，经济的方式来研究海洋动物的运动，普及，…分布和丰富。

Dnascientientists调查大西洋中的新海洋生命迁移模式浮出水面的遗传痕迹，远离他们通常的南方家园。

雷 - 巴西·卡罗西雷，犀牛·奶酪和海湾翠鸟，Menticirhus littoralis，当时在新泽西州的巴尼托入口温暖时，大约有两个小时的纽约城市。

在墨西哥湾北部的美国，光线从未记录过;鲈鱼海湾翠鸟从未在弗吉尼亚州切萨皮克湾以北北部录制，约250英里（400公里）到南方。

对于水生环境DNA（EDNA）测试的越来越多的应用程序：一种创新，廉价，低影响的方式，可以监控海洋生命迁移，改变范围，普及和分布。

由洛克菲勒大学的Mark Stoeckle领导，并在海洋科学的广场发表，该研究涉及每月绘制海水两年两年，并测试其遗传物质 - DNA含有粘性，凝胶状的凝胶状外涂层的细胞。因为它在例如在捕食者的作战中脱落的组织片段中游泳，或者死亡或损伤。

Stoeckle博士解释说，DNA在动物离开的几天内降解并分散，但在水中徘徊，尽管有电流和潮汐，足以检测物种的流逝。

两年多，从2017年春季到2019年春季，采样在一对Barnegat入口，NJ站点内，在几英里的彼此之内 - 一个外岸，以举办大西洋水域，以及庇护湾内。

2010年，海洋生命计划的普查，海洋动物种群（FMAP）的未来，预测基于现有栖息地和预期水温变化的海洋物种的普遍性的变化。

通过DNA发现落后于新泽西州的海岸，栖息地海湾·王鱼从未在弗吉尼亚州切萨皮克湾以北北部录制，约250英里（400公里）到南方。随着气候，化学污染，泥石，噪声，夜间照明等因素的变化，“本研究进一步建立了水生环境DNA（EDNA）作为监测海洋生物的创新，廉价，低潜力的方式迁移，改变范围，普及和分布，“Jesse Ausubel说。

洛克菲勒大学人类环境方案总监Jesse Ausubel和Coml的联合创始人表示，巴西队的Cownose Ray或海湾翠鸟远离其已知范围的北方的北方的距离适合FMAP的预测，同时注意其他解释仍然可能。例如，动物可能只逃避了新泽西拖网网多年。

随着气候，化学污染，碎片，噪音，夜间照明等因素的变化，Ausubel强调先生，“本研究进一步建立了水生环境DNA（EDNA）作为一种创新，廉价，低影响力监控海洋生命迁移，改变范围，普及和分布的方式。“

STOECKLE博士说：“有希望的工作也在进行中，以确认海水中物种DNA的浓度与水中的丰富之间的关系。如果水样可以提供定义的海洋区域中给定物种的鱼类的数量或总重量的指数，这提供了可持续渔业和海洋管理的潜在跨越，提高了鱼类配额的合理性和质量他们在世界各地监测的可靠性。“

莫斯茅斯大学城市海岸研究所托尼麦克唐纳州，有助于启动这项工作，增加：“普氏造伏的海洋鱼类和其他动物通常涉及昂贵，耗时的调查，具有专业设备和人员。埃德纳科学授予人类一个非常古老的愿望：估计河流，湖泊和海洋的黑暗水域中的佩戴鱼类和其他形式的水生生物的分布和丰富的岩石。“

与高中和大学生一起学习纽约港和哈德逊河的博士，补充说，“收集过程足够简单，对于任何地方任何海岸的监督学童或公民科学家有助于监测所有的变化范围海洋生物。”Co-Tress Mithun Das Mishu在亨特学院担任大二的时候加入了该项目。

绘制水后，将其过滤以浓缩DNA进行萃取。DNA的靶段在实验室中扩增，然后送出“下一代”测序，结果 - 将样品中所有DNA序列的记录送入计算机软件，该计算机软件归入副本的副本每个序列和在线公共参考库中的匹配项。

新泽西州学习，由Mishu和Bioinformatics专家Zachary Charlop-Powers，以一致的季节性模式检测到骨鱼类。他们发现少数物种占了大多数DNA所获得的。

同时，射线和其他软骨物种的检测主要是受温暖的月份。

除了将其遗传物质从水中进行紧张，研究人员使用DNA在2017年8月在抽样区域中追踪上岸的巴西Cownose Ray的腐朽遗体。

研究人员还添加到生长的全球数据库中，这是来自过去30年的拖网调查的新泽西州科学家编目的31个区域物种的第一个DNA参考序列。

Stoeckle博士早期的纽约东部和哈德森河的研究揭示了几种穿过这些水域的关键鱼类的存在或不存在。每周数据快照创建了一个运动图片，这些运动图像与多年的鱼网拖网中的知识加强和相关。

通过随着时间的推移进行一系列测试，这项工作开创了一种创造鱼类迁移的新方法。德纳有一个金发姑娘质量恰到好处，斯托克勒斯博士：如果它太快消失了，抽样不会告诉我们很多;如果它徘徊过长，DNA太多会在水中，破坏有用，及时的见解。

后续步骤包括微调校准，比较EDNA“读取”并使用与网和声纳进行的传统调查的数据进行比较。100 DNA“阅读”表明存在1个鱼或10条鱼？

还要确定：不同鱼类和其他海洋物种脱落DNA的速率。

参考：“改进的环境DNA参考文库检测到美国的新泽西州的忽视海洋鱼类”由Mark Y. Stoeckle，Mithun Das Mishu和Zachary Charlop-Powers，5月5日，海洋科学的前沿：
10.3389 / FMARS.2020.00226