新的遗传测试可有效筛查遗传性癌症

研究人员在《分子诊断学杂志》（The Journal of Molecular Diagnostics）上报告说，一项测试可以鉴定出遗传性结肠癌，子宫内膜癌和其他癌症中错配修复缺陷综合症背后的众多遗传变异的已知来源。

研究人员已经开发出一种称为MultiMMR的新的整合遗传/表观遗传DNA测序方案，该方案可以通过一次检测结肠癌，子宫内膜癌和其他癌症中的少量DNA来鉴定错配修复（MMR）缺陷的存在和原因。这种替代复杂的多步骤测试工作流程的方法还可以确定当前临床测试经常遗漏的MMR缺乏的原因。他们的研究结果发表在爱思唯尔（Elsevier）出版的《分子诊断学杂志》（The Journal of Molecular Diagnostics）中。

MMR基因监测并修复正常细胞复制和重组中可能发生的错误。在某些遗传性和获得性癌症中，一种或多种MMR基因被失活。“ MultiMMR的影响是广泛的。患有MMR缺乏症的肿瘤对新的癌症免疫疗法反应良好。大学健康网玛格丽特公主癌症中心；以及加拿大安大略省多伦多市安大略癌症研究所。“确定个体是否具有遗传性MMR缺乏症的形式，还可以使临床医生对患者进行积极的监测，采取降低风险的策略并向亲属提供基因检测，从而有可能改善患者的预后。”

研究人员已经开发出一种称为MultiMMR的新的整合遗传/表观遗传DNA测序方案，该方案可以通过一次测试从结肠，子宫内膜癌和其他癌症中的少量DNA样本中识别错配修复（MMR）缺陷的存在和原因。这种替代复杂的多步骤测试工作流程的方法还可以确定当前临床测试经常遗漏的MMR缺乏的原因。他们的研究结果发表在爱思唯尔（Elsevier）出版的《分子诊断学杂志》（The Journal of Molecular Diagnostics）中。

MMR缺乏症的标准临床测试可能会不一致，需要多种测试和专业知识类型，导致患者的护理欠佳。下一代测序测试已获得普及，并正在临床实验室中使用。但是，他们并未发现MMR缺乏症的所有遗传变异，因此经常需要进行额外的检测。

MultiMMR同时测试启动子的甲基化，突变，拷贝数状态，拷贝中性丢失的杂合性和来自少量DNA的微卫星不稳定性。在这项研究中，研究人员对来自82例MMR相关结直肠癌，子宫内膜癌和脑癌患者的142个样本（82个正常样本和60个肿瘤样本）的DNA进行了测序。作为阳性对照，将45例患者的结果与使用常规测定的先前临床测试进行了比较。他们还使用MultiMMR对可商购获得的DNA对照进行了分析，其中包括11个变异，这些变异很难用下一代测序进行检测。

为了检测是否存在MMR缺乏症，MultiMMR启动子甲基化和微卫星不稳定性分析分别发现与临床测试一致，分别为95％和97％。在检测导致MMR缺乏的变体中，MultiMMR与24例病例中的23例的临床测试结果相符。该测试在多个测序运行中鉴定出合成混合物中的所有11个突变，并通过不完整或不确定的测试鉴定了29位患者的错配修复缺陷。专家组能够确定当前临床级联经常遗漏的MMR病因。

“我们已经证明，可以通过单次DNA样本的单一检测来确定MMR的存在和原因，从而充分利用可用组织，简化工作流程并改善Lynch和相关遗传性癌症的综合报告，”主要作者莱斯利·奥尔德菲尔德（Leslie Oldfield），多伦多大学医学生物物理学系理学硕士。加拿大安大略省多伦多大学健康网络的玛格丽特公主癌症中心。

研究人员指出，当前的级联检测方案可能无法满足结直肠癌和子宫内膜癌患者对通用肿瘤检测的日益增长的需求。例如，许多下一代测序测试并未筛选微卫星不稳定性和启动子甲基化以及体细胞突变。

“获得免疫治疗的资格通常取决于MMR的状态，因此及时而强大的测试很重要，” Oldfield女士补充道。“ MultiMMR简化了流程，并通过缩短周转时间来区分MMR缺乏症的类型，可以随着需求的增加而很好地扩展，并可以为临床医生提供重要的信息，以告知患者管理和治疗决策。”

参考：Leslie E. Oldfield，Tiantian Li，Alicia Tone，Melyssa Aronson，Melissa Edwards，Spring Holter，Rene Quevedo，Emily Van de Laar，Jordan Lerner-Ellis和Aaron Pollett撰写的“用于评估错配修复缺陷的综合DNA测序和甲基化专家组” ，布莱斯·克拉克（Blaise Clarke），乌里·塔博里（Uri Tabori），史蒂芬·加林格（Steven Gallinger），莎拉·E·弗格森（Sarah E.Ferguson）和特雷弗·J·普（Trevor J.Pugh），2021年11月28日，《分子诊断学杂志》。
10.1016 / j.jmoldx.2020.11.006

这项研究得到了加拿大研究主席计划，安大略省癌症研究所高级研究人员奖IA-063，玛格丽特公主癌症基金会的加图索·斯莱特个性化癌症医学基金，加拿大癌症协会研究院拨款704038，BioCanRx和加拿大基金会的支持创新领袖机会基金赠款32383。