三月的多重企鹅基因组 - 广泛的研究提供了无与伦比的信息

在南极洲的Gentoo企鹅形成一条线，因为他们游行了一个“企鹅高速公路”以收集巢穴的岩石。

一篇旨在捕获所有生活企鹅物种的全部基因组景观的一篇文章正在明天（2019年9月18日）在开放式期刊吉普学刊中公布。企鹅基因组联盟 - 从中​​国，丹麦，新西兰，澳大利亚，阿根廷，南非，英国，美国，法国和德国的研究人员汇集在一起​​ - 已经生产了19个高覆盖的企鹅基因组序列，其中包括两个以前发表的基因组，包括所有存活的企鹅物种。这项广泛的研究提供了一种无与伦比的信息，涵盖整个生物秩序，这将促进各种各样的地区的研究，从进化到人类活动的影响和环境变化。

企鹅是跨越南半球的普遍存在的物种，从赤道的Galápagos群岛到新西兰的海洋温带森林，到南极群岛的岩石海岸线，终于到了南极洲周围的海冰。这种标志性的鸟类群体从飞行海鸟转向强大，飞行的海洋船用。凭借其专业的皮肤和羽毛和增强的热调节系统，它们能够从极冷的南极海冰居住的环境到热带Galápagos群岛。

“在他们的基因组中可以看到不同企鹅物种的人口历史。我们将为所有企鹅的人口历史提供新的洞察，以预测未来气候变化情景下的人口趋势。“ - Theresa Cole.

这些鸟类还作为煤矿的比喻“金丝雀” - 环境和气候变化的警告。近几十年来，许多企鹅群体经历了迅速下降，有些人口下降，例如企鹅王人口的撞车，在短短3年内下降了88％。预计不久的未来预计企鹅物种将下降。Dwindling群体与气候变暖，环境退化，海洋环境开发，渔业​​兼捕，污染和异国情调捕食者的引入有关。因此，企鹅已成为许多生态系统监测研究的重点。拥有所有现存企鹅物种的高质量基因组序列是理解物种人口损失的具体原因的杰出新资源。

这是南极洲的一个唐塔普宫。

来自新西兰奥塔哥大学的作者Theresa Cole说这项工作：“在他们的基因组中可以看到不同企鹅物种的人口历史。我们将为所有企鹅普鲁斯历史的人口历史提供新的见解，以预测未来的气候变化情景下的人口趋势。本研究将有助于我们了解未来的气候变化如何影响其他物种，以帮助我们开发保护策略。“

与达尔文雀的工作一样，研究20个企鹅物种的辐射提供了研究独特的企鹅形态和生理适应性的类似启示案例研究。该联盟还在测序最近灭绝的企鹅群的基因组，以及使用每种物种的多种基因组进行人口基因组研究。

高级作者从哥本哈根大学，BGI，昆明动物学院张张某所说：“企鹅祖先经历了快速辐射，导致目前的20个现存物种，伴随着众多古代血统，现在灭绝了。因此，企鹅的辐射为物种研究提供了一个很好的例子。“

这些是2018年12月在南极洲的Gentoo企鹅。

对于所有这些物种来说，有后勤挑战，因为许多人来自全球的一些最不居住的食物和远晃动。然而，额外的挑战是文化而不是技术。本联盟处理这些敏感问题的过程是建立信任和合作的模型，与其他原生物种具有同样重要的联系。

共同作者Bruce McKinlay来自新西兰保护部门突出了这一点，称：“新西兰的基因组研究目前正在进入新颖的文化背景，特别是对于企鹅，这是喀罗利文化中的陶谷或珍贵的财产。因此，我们的财团承担了严格的土着咨询，以序列来自六个新西兰Taonga物种的基因组。我们认为这些基因组对文化背景很重要。“

企鹅基因组联盟项目的第一阶段的目标纯属依赖于序列高质量的基因组，但初始验证研究已经证明这些基因组已经产生了对企鹅生命之树的进化历史的宝贵洞察力和他们的进化模式适应南极洲。例如，本研究中呈现的初始系统发育树表明企鹅在多次适应南极。

目前正在进行这种和进一步的比较和进化基因组分析，企鹅基因组联盟欢迎有兴趣加入公开联盟并为这项工作提供贡献的新成员。虽然这项工作仍然正在进行早期进入19个企鹅基因组数据，但研究人员要求将群体打算使用此数据进行类似的跨物种比较，以遵循长期劳德代尔和多伦多规则。

参考：“高覆盖基因组来阐明企鹅的演变”，Hailein Pan，Theresa L Cole，Xupeng Bi，Miaoquan Fang，Chengran Zhou，Zhengtae yang，Daniel T Ksepka，Tom Hart，Juan L Bouzat，Lisa S argilla，Mads F Brettelsen ，P dee Boersma，Charles-AndréBost，伊夫·克莱尔，彼得·丹兰，史蒂文R Fiddaman，Pauline Howard，Kim Labuschagne，托马斯特玛，加里米勒，Patricia Parker，Richard A Phillips，Petra Quillfeldt，Peter G Ryan，Helen Taylor，Lehen Taylor，Helen Taylor，Helen Taylor，Lehen Taylor r汤普森，梅兰妮j young，martin r ellegaard，m托马斯p gilbert，麦克斯 - 霍尔格山脉，乔治·佩奇，拉拉D牧羊犬，艾伦·丁尼尼，斯维坦格罗尔，艾米丽凯，丽莎···纳登，乌苏拉·埃伦伯格，大卫·休斯顿， Andrew Hart Reeve，Kathryn Johnson，Juan F Masello，Thomas Stracke，Bruce McKinlay，PabloGarcíaBorboroglu，De-xing Zhang and Guojie Zhang，2019年9月18日，Gigascience.doi：
10.1093 / gigascience / giz117