分子映射定位自身免疫疾病的遗传变异
研究人员开发了一种分子图,可以针对在21种不同的自身免疫疾病中起作用的遗传变异,为多发性硬化和其他自身免疫疾病的原因提供新的洞察力。
耶鲁研究员,加州大学 - 旧金山(UCSF)以及广泛的麻省理工学院和哈佛大学发展了一款复杂的数学模型,并创建了一起使它们能够识别哪些变体导致免疫反应的不同细胞类型的地图并引起特定疾病。
“这些调查结果为多发性硬化症和其他自身免疫疾病的原因提供了新的洞察力,”耶鲁·哈弗·哈夫勒(Gilbert H. Glaser)神经内科教授,神经病学系和联合高级作者本文。
发现人类自身免疫疾病等多发性硬化,类风湿性关节炎,克罗恩病和糖尿病的潜在原因已被忽略。对自身免疫性疾病患者基因区域的密集调查鉴定了数百种不同疾病中共用的常见基因变异。但这些变体如何引发这种多种渗透疾病尚不清楚。
研究人员使用了他们开发的数学模型来分析自身免疫患者的全基因组关联研究数据,发现DNA - 称为单核苷酸多态性的微小变异,或者在免疫系统反应的母遗传调节剂附近发生近似的SNPS。然后,他们从由国家健康机构(NIH)的表观组织项目编制的数据(NIH)编制的数据中创建了“地图”,该联邦资助的努力将人类基因组的监管机制划出跨各种细胞类型。当他们与新的细胞地图进行了与新的细胞地图进行了比较时,研究人员精确地针对哪种细胞类型导致每个自身免疫性疾病以及这些DNA变异如何诱导免疫细胞去AWRY。
“引起自身免疫疾病的遗传变化是微妙的。他们很少替代蛋白质功能,因此,难以研究,Broad Institute,Massachusetts综合医院病理学教授和该研究的共同高级作者,Broad Institute教授Bradley Bernstein表示。“在这里,我们组合新的遗传和表观遗传方法,了解这些遗传变化如何改变免疫功能和引起疾病。”
例如,发现强烈将神经疾病MS的原因与免疫系统相连。令他们惊讶的是,研究人员发现没有影响神经系统的遗传变异。哈菲勒说,结果提供了MS是一种自身免疫性疾病,证明免疫系统的主要作用。
“这与新的MS治疗高度一致,这些治疗方法在免疫系统上工作,表明我们终于对MS的潜在原因有很好的句柄,”他说。
凯尔凯 - 来自UCSF的广泛研究所和Alexander Marson的哈哈是本文的第一作者。
该研究的主要资金由NIH和国家多发性硬化系统提供。
出版物:Kyle Kai-Faverh,Et S1。,“因果性自身免疫疾病变种的遗传和表观遗传学精细映射,”自然(2014); DOI:10.1038 / Nature13835
图像:迈克尔·S·赫尔芬贝因