科学家确定精神分裂症的细胞类型
从单细胞转录组测序数据计算出的特异性指标可用于测试脑细胞类型中精神分裂症-SNP遗传力的负担增加。a,比较2级细胞类型类别和接受snRNA-seq或scRNA-的细胞数量来自脑组织的序列。梅花色圆圈是小鼠研究,而蓝色圆圈是人类研究。不同组织的数量反映在圆圈的大小中(有关引用,请参见补充表2)。AIBS,艾伦脑科学研究所; KI,Karolinska Institutet.b,来自KI超集级别1的MSN的特异性度量( S MSN,KI)直方图。彩色区域表示十分位数(棕色区域包含对MSN最特有的基因)。多巴胺受体D2(Drd2, S MSN,KI,Drd2 = 0.17)的特异性值由箭头c表示。示意图以蓝色突出显示了KI数据集中采样的大脑区域。d,KI级别为1一系列已知细胞类型标记的数据集。胚芽,胚芽; Hypoth。,hyperthalamic.e,精神分裂症-SNP遗传力在每个MSNs特异性位点中的富集(使用LDSC计算)。点的颜色对应于特异性矩阵inb的区域。浅蓝色点(标记为“ X”)表示所有映射到非MGI注释基因的命名转录本上或映射到不具有1:1小鼠:人类直系同源物的基因上的所有SNP。深蓝色点(标记为“ N”)代表所有映射到未在MSN中表达的基因的SNP。蓝线显示了与富集值拟合的线性回归斜率。f,MSN的每个特异性指标中的高度SNP遗传力的富集。颜色为ine。Ineandf,误差线表示95%置信区间.Nature Genetics(2018)doi:10.1038 / s41588-018-0129-5
瑞典卡罗林斯卡研究所和美国北卡罗来纳大学的科学家在《自然遗传学》上发表的一项新研究中确定了精神分裂症的细胞类型。研究结果为针对这种疾病的新疗法的开发提供了路线图。
精神分裂症是一种通常具有破坏性的疾病,引起巨大的人类痛苦。遗传学研究已将数百种基因与精神分裂症相关联,每个基因对罹患该疾病的风险均贡献很小的一部分。大量已鉴定的基因使设计实验变得困难。科学家们一直在努力了解将这些基因联系在一起的原因,以及这些基因是否会扩散性地影响整个大脑或某些成分。
通过将大脑中不同细胞类型中使用的所有基因的新图谱与精神分裂症相关基因的详细列表结合起来,当前研究中的科学家可以鉴定出导致该疾病的细胞类型。遗传学表明某些细胞类型比其他细胞类型牵连得多。一个发现是,似乎有几种主要的细胞类型导致了这种疾病,每种类型都起源于大脑的不同区域。
“这标志着我们如何使用大型基因研究来了解疾病生物学的一种转变。这项研究的结果使我们为科学界提供了一个机会,使他们可以将精力集中在发挥最大作用的地方”,Karolinska研究所医学生物化学与生物物理系研究组组长Jens Hjerling-Leffler说,主要作者。
研究结果为开发新疗法提供了路线图。
“现在的一个问题是这些脑细胞类型是否与精神分裂症的临床特征有关。例如,一种细胞类型更大的功能障碍会使治疗反应的可能性降低。不同细胞类型的功能障碍可能会增加长期认知作用的机会。这将对新疗法的开发产生重要影响,因为每种涉及的细胞类型可能都需要单独的药物。北卡罗来纳大学遗传与精神病学系。
由于在两个独立的科学领域中取得了迅速的进步;人类遗传学和单细胞转录组学,直到最近才有可能以这种方式研究疾病。在未来的几年中,研究人员建议该方法应在对其他复杂疾病(例如自闭症,重度抑郁症和进食障碍)的生物学理解方面取得突破。
“了解哪种细胞类型受疾病影响对于开发新药以改善其治疗至关重要。如果我们不知道是什么原因引起的疾病,我们就不能研究如何治疗它。”主要作者之一,英国卡罗林斯卡研究所和UCL神经病学研究所医学生物化学与生物物理学系的博士后Nathan Skene说。
出版物:Nathan G. Skene等人,“精神分裂症潜在的脑细胞类型的遗传鉴定”,《自然遗传学》(2018)doi:10.1038 / s41588-018-0129-5